22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0061 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  74.7 
 
 
168 aa  265  3e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  73.05 
 
 
167 aa  261  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.19418e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  71.08 
 
 
166 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  39.39 
 
 
169 aa  139  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  39.41 
 
 
171 aa  138  4e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  40.49 
 
 
166 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  35.58 
 
 
163 aa  120  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  110  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.70899e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  32.92 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  30.72 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  41.33 
 
 
204 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  29.63 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  29.63 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  32.72 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1710  hypothetical protein  59.62 
 
 
55 aa  65.9  3e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  26.49 
 
 
201 aa  57  1e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  26.95 
 
 
183 aa  55.8  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  26.28 
 
 
245 aa  47.8  9e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  29.9 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>