64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0067 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0067  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0021  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0043  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00614253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0049  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0852361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0038  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0053  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.046905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0058  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392765  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0693  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0702  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0836  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.20631e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0060  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000314996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0068  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t063  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000070127  hitchhiker  0.00000000885042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0057  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118539  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t042  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0051  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.046905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0094  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242696  normal  0.386091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0096  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00280984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0099  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00219559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0101  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00407806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0103  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00197165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0070  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000013606  normal  0.202636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0078  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0197112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0066  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241588  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t034  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0083  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000521603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0093  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000115835  hitchhiker  0.00000126474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0083  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000198028  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0097  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00055295  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0056  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.432315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0043  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000926476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0080  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000246163  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0090  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000152195  normal  0.0212765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0062  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000588832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0068  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000602799  normal  0.450807 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t02  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0046  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000220142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0058  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0062  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000739962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t072  tRNA-Cys  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000613196  normal  0.0212572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna006  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0073  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000369177  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna004  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna001  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna119  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000033796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3176t  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000794009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05672  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0065  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000190442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0071  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0114475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0090  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00230411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4237  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.48815e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02745  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2056  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000925021  hitchhiker  0.000585084 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05678  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05683  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0087  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0090  tRNA-Cys  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05684  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tCys01  tRNA-Cys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60570  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0030  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3170t  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0586308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0024  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0045  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0596059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>