19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2756 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 
264 aa  517  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  26.07 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  21.63 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  21.74 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  21.74 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  21.74 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  22.08 
 
 
167 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  29.41 
 
 
153 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  22.3 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  22.08 
 
 
165 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  23.65 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  26.32 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  22.08 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  19.41 
 
 
167 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  19.31 
 
 
165 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  20.75 
 
 
164 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  21.23 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0750  hypothetical protein  29.36 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.864897  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1051  hypothetical protein  26.32 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0934481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>