13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1042 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  50.72 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  35.12 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  31.14 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  32.33 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  26.98 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  28.28 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  29.9 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  25.88 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  28 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  28.19 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  27.59 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>