20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0094 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  100 
 
 		 140 aa  293  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  65.71 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  65 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  65.71 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  65 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  61.67 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  61.67 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  48.55 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  40.62 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  39.53 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  37.29 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  43.22 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  38.76 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  39.53 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  38.58 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  37.96 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  38.66 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  36.07 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  36.07 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>