33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1263 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  46.13 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  44.09 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  46.7 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  44.41 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  40.62 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  36.6 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  34.67 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  36.93 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  35.74 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  32.68 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  33.88 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  25.51 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000226097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  25.29 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  25.36 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  25.36 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  24.41 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  25.56 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  25.72 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  28.99 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  28.85 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  26.34 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  32.98 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  36.87 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  32.02 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  33.33 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  35.64 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  30.92 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  30.5 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  33.72 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  0.0000136786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4402  hypothetical protein  31.91 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>