17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0728 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00293  hypothetical protein  60.13 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3886  hypothetical protein  56.95 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3560  hypothetical protein  63.91 
 
 		 168 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3220  hypothetical protein  57.72 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000447728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4245  hypothetical protein  47.73 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000472538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0147  hypothetical protein  34.85 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1073  hypothetical protein  32.06 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.440482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0070  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0499  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2061  hypothetical protein  34.11 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2814  hypothetical protein  31.01 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0073  hypothetical protein  33.85 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1339  hypothetical protein  33.03 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1691  hypothetical protein  28.89 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1844  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>