22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1368 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1368  lipoprotein, putative  100 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00111167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1181  hypothetical protein  76.84 
 
 		 95 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.731891  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  44.12 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  45.9 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  45.9 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  45.9 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  45.9 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  45.76 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  45.9 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  45.9 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  45.9 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  41.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  37.14 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11880  hypothetical protein  39.08 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>