14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0243 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  69.79 
 
 		 235 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  52.78 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  45.6 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  40.48 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  47.31 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  47.26 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  44.44 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  47.06 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  43.71 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  43.35 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  40.83 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  46.22 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  28.48 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>