20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0062 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  97.83 
 
 		 138 aa  253  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  59.42 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  60.14 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  59.42 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  57.97 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  59.29 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  51.11 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  38.69 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  38.89 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  39.34 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  35.43 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  33.33 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  34.13 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>