20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0062 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  100 
 
 
138 aa  284  3e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  97.83 
 
 
138 aa  253  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  59.42 
 
 
137 aa  181  4e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  60.14 
 
 
137 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  59.42 
 
 
137 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  57.97 
 
 
137 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52453e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  59.29 
 
 
140 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  51.11 
 
 
139 aa  133  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  42.37 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  38.69 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  38.89 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.39404e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  38.1 
 
 
137 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  38.1 
 
 
137 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  39.34 
 
 
137 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  35.43 
 
 
144 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  33.33 
 
 
140 aa  77  8e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  33.07 
 
 
162 aa  72  2e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  34.13 
 
 
145 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  34.13 
 
 
145 aa  65.5  3e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>