32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3805 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2086  hypothetical protein  88.57 
 
 		 350 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3805  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2111  hypothetical protein  93.41 
 
 		 350 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1964  hypothetical protein  98.29 
 
 		 350 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44514  normal  0.164812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3749  hypothetical protein  68.57 
 
 		 362 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.793318  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2489  hypothetical protein  62.93 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2293  hypothetical protein  62.29 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934293  decreased coverage  0.0000360604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3970  putative lipoprotein  64.08 
 
 		 367 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29270  putative outer membrane lipoprotein  64.33 
 
 		 367 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03430  DUF1615 family hypothetical protein  65.79 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0491  protein of unknown function DUF1615  64.14 
 
 		 365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0988  hypothetical protein  62.86 
 
 		 367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0410  hypothetical protein  64.97 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0412  putative outer membrane lipoprotein  59.66 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  hitchhiker  0.00807805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0450  putative lipoprotein  58.87 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0413  putative outer membrane lipoprotein  59.66 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0431  putative outer membrane lipoprotein  59.38 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.718831  normal  0.526755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0407  putative lipoprotein  63.01 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0473  hypothetical protein  59.66 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0419  hypothetical protein  59.66 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00325  predicted DNA-binding transcriptional regulator  62.7 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3254  hypothetical protein  62.7 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0402  putative lipoprotein  62.7 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0443  putative lipoprotein  62.7 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0847  hypothetical protein  60.67 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00329  hypothetical protein  62.7 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.368977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3230  protein of unknown function DUF1615  62.38 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0295  putative lipoprotein  62.07 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04182  lipoprotein, putative  57.39 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4181  hypothetical protein  49.11 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1490  protein of unknown function DUF1615  32.39 
 
 		 376 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.776486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1489  hypothetical protein  31.09 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>