More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1342 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0927  cell division protein FtsZ  88.44 
 
 
397 aa  648  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  8.29839e-07  normal  0.686673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4403  cell division protein FtsZ  94.47 
 
 
395 aa  658  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00309218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0949  cell division protein FtsZ  100 
 
 
398 aa  797  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4668  cell division protein FtsZ  93.97 
 
 
398 aa  685  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  9.10639e-08  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4382  cell division protein FtsZ  100 
 
 
398 aa  797  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  2.71138e-07  normal  0.178882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1342  cell division protein FtsZ  100 
 
 
398 aa  797  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00615474  decreased coverage  9.64592e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4979  cell division protein FtsZ  87.94 
 
 
394 aa  637  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4097  cell division protein FtsZ  94.47 
 
 
395 aa  669  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0231249  normal  0.411425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4507  cell division protein FtsZ  99.75 
 
 
398 aa  795  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  2.53019e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13300  cell division protein FtsZ  87.19 
 
 
394 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00394916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57275  cell division protein FtsZ  86.68 
 
 
394 aa  624  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.84485e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2447  cell division protein FtsZ  68.33 
 
 
385 aa  470  1e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00131547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0853  cell division protein FtsZ  67.73 
 
 
390 aa  461  1e-128  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.55156e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2185  cell division protein FtsZ  65.43 
 
 
394 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  7.51691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  64.68 
 
 
382 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2187  cell division protein FtsZ  65.33 
 
 
379 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0151273  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0775  cell division protein FtsZ  64.44 
 
 
384 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2195  cell division protein FtsZ  62.84 
 
 
385 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  3.89118e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  62.56 
 
 
386 aa  417  1e-115  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1966  cell division protein FtsZ  61.69 
 
 
393 aa  416  1e-115  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  3.88917e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0230  cell division protein FtsZ  61.69 
 
 
386 aa  416  1e-115  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.97821e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0607  cell division protein FtsZ  60.78 
 
 
411 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4459  cell division protein FtsZ  60.25 
 
 
386 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04362  cell division protein FtsZ  60.87 
 
 
396 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1964  cell division protein FtsZ  58.82 
 
 
411 aa  405  1e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  8.93853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2043  cell division protein FtsZ  58.82 
 
 
411 aa  405  1e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  8.92067e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3514  cell division protein FtsZ  58.9 
 
 
390 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  4.11228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2855  cell division protein FtsZ  62.31 
 
 
385 aa  401  1e-110  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.29546e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2532  cell division protein FtsZ  60.93 
 
 
398 aa  401  1e-110  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2662  cell division protein FtsZ  61.18 
 
 
398 aa  401  1e-110  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1975  cell division protein FtsZ  58.56 
 
 
398 aa  398  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.04348e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2609  cell division protein FtsZ  56.63 
 
 
409 aa  400  1e-110  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.86054e-08  unclonable  4.62824e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3449  cell division protein FtsZ  60.74 
 
 
391 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.99378e-06  unclonable  2.45558e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4529  cell division protein FtsZ  59.6 
 
 
392 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.37057e-07  unclonable  2.85866e-08 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2640  cell division protein FtsZ  59.71 
 
 
411 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000115675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3807  cell division protein FtsZ  59.26 
 
 
395 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.51722e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2263  cell division protein FtsZ  56.22 
 
 
387 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00432482  hitchhiker  0.000536698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0615  cell division protein FtsZ  58.71 
 
 
383 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000348627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  57.04 
 
 
412 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.38427e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0088  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.79659e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0100  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.45858e-09  normal  0.622573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0142  cell division protein FtsZ  59 
 
 
383 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000809484  normal  0.893784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0097  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.52178e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0101  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.47391e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  55.95 
 
 
415 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0641  cell division protein FtsZ  58.6 
 
 
383 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  9.696e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0149  cell division protein FtsZ  59 
 
 
383 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000359528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0103  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.59609e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0145  cell division protein FtsZ  59 
 
 
383 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0351517  hitchhiker  9.64056e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0145  cell division protein FtsZ  59 
 
 
383 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000120308  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0414  cell division protein FtsZ  59.35 
 
 
391 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.71858e-07  hitchhiker  0.00156987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3562  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.63859e-05  normal  0.0129736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3800  cell division protein FtsZ  59.7 
 
 
388 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.71095e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0358  cell division protein FtsZ  59.11 
 
 
394 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.26456e-08  unclonable  7.63444e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0150  cell division protein FtsZ  59 
 
 
383 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.13704e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00095  hypothetical protein  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.62497e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3505  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.63693e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  57.21 
 
 
380 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3775  cell division protein FtsZ  58.17 
 
 
383 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  8.84705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3587  cell division protein FtsZ  58.17 
 
 
383 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00015207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00096  cell division protein FtsZ  58.75 
 
 
383 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3566  cell division protein FtsZ  59.36 
 
 
395 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.96919e-07  decreased coverage  5.12084e-10 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2488  cell division protein FtsZ  55.42 
 
 
389 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0022713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3739  cell division protein FtsZ  59.36 
 
 
395 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.17784e-07  unclonable  1.19361e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0390  cell division protein FtsZ  59.36 
 
 
395 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00071655  unclonable  3.574e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0653  cell division protein FtsZ  57.96 
 
 
383 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  2.29e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4215  cell division protein FtsZ  59.36 
 
 
395 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0766  cell division protein FtsZ  57.82 
 
 
384 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.74251e-09  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0431  cell division protein FtsZ  58.01 
 
 
395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  6.94635e-09  hitchhiker  6.69331e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0359  cell division protein FtsZ  58.09 
 
 
395 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.96316e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3513  cell division protein FtsZ  58.1 
 
 
383 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000471065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0405  cell division protein FtsZ  58.01 
 
 
395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.19039e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2913  cell division protein FtsZ  58.1 
 
 
383 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.66875e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0417  cell division protein FtsZ  58.01 
 
 
395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  8.86919e-06  unclonable  5.57557e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0406  cell division protein FtsZ  58.01 
 
 
395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.85865e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3382  cell division protein FtsZ  58.1 
 
 
383 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.04455e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1698  cell division protein FtsZ  62.66 
 
 
454 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0491  cell division protein FtsZ  57.52 
 
 
395 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.54603e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0517  cell division protein FtsZ  55.83 
 
 
390 aa  373  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0200  cell division protein FtsZ  55 
 
 
387 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.719937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0379  cell division protein FtsZ  55 
 
 
387 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000173126  normal  0.037859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0455  cell division protein FtsZ  54.09 
 
 
381 aa  352  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.50066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0560  cell division protein FtsZ  53.9 
 
 
396 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.2227e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0497  cell division protein FtsZ  48.99 
 
 
386 aa  337  3e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  6.33261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0514  cell division protein FtsZ  48.74 
 
 
386 aa  336  3e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0417  cell division protein FtsZ  49.87 
 
 
384 aa  332  7e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857651  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2782  cell division protein FtsZ  46.63 
 
 
391 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  5.04391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3063  cell division protein FtsZ  50.63 
 
 
383 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0617944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3968  cell division protein FtsZ  49.5 
 
 
383 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.27539e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2974  cell division protein FtsZ  51.75 
 
 
398 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00404653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0751  cell division protein FtsZ  49.88 
 
 
424 aa  323  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3123  cell division protein FtsZ  51.62 
 
 
396 aa  321  2e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3778  cell division protein FtsZ  51.7 
 
 
405 aa  320  2e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2196  cell division protein FtsZ  50.5 
 
 
386 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.76072e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0363  cell division protein FtsZ  55.12 
 
 
371 aa  316  5e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  2.81943e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3474  cell division protein FtsZ  48.04 
 
 
413 aa  313  2e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.010382  normal  0.182224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3084  cell division protein FtsZ  50.61 
 
 
399 aa  313  3e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15044  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2719  cell division protein FtsZ  50.26 
 
 
399 aa  313  4e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2602  cell division protein FtsZ  49.87 
 
 
416 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0442684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3918  cell division protein FtsZ  50.52 
 
 
405 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>