More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4529 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0414  cell division protein FtsZ  93.37 
 
 
391 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  hitchhiker  0.00156987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4529  cell division protein FtsZ  100 
 
 
392 aa  774    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000237057  unclonable  0.0000000285866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3807  cell division protein FtsZ  90.18 
 
 
395 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000351722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3449  cell division protein FtsZ  90.59 
 
 
391 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000299378  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0358  cell division protein FtsZ  88.38 
 
 
394 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000326456  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4215  cell division protein FtsZ  88.38 
 
 
395 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3566  cell division protein FtsZ  88.38 
 
 
395 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000796919  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0390  cell division protein FtsZ  88.38 
 
 
395 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00071655  unclonable  0.00003574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3739  cell division protein FtsZ  88.38 
 
 
395 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000117784  unclonable  0.000000000119361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0491  cell division protein FtsZ  87.63 
 
 
395 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000254603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0405  cell division protein FtsZ  87.12 
 
 
395 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0417  cell division protein FtsZ  87.12 
 
 
395 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000886919  unclonable  0.00000557557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0406  cell division protein FtsZ  87.12 
 
 
395 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000385865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0431  cell division protein FtsZ  87.12 
 
 
395 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000694635  hitchhiker  0.0000000000669331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3800  cell division protein FtsZ  86.29 
 
 
388 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000371095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0359  cell division protein FtsZ  84.63 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4459  cell division protein FtsZ  73.5 
 
 
386 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1975  cell division protein FtsZ  69.65 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000804348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3514  cell division protein FtsZ  70.3 
 
 
390 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000411228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0766  cell division protein FtsZ  70.25 
 
 
384 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000874251  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0653  cell division protein FtsZ  69.25 
 
 
383 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2913  cell division protein FtsZ  70 
 
 
383 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000966875  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3382  cell division protein FtsZ  70 
 
 
383 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3513  cell division protein FtsZ  70 
 
 
383 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000471065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  66.27 
 
 
415 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  65.86 
 
 
412 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000238427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3775  cell division protein FtsZ  69.42 
 
 
383 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000884705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0615  cell division protein FtsZ  70.38 
 
 
383 aa  474  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000348627  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0145  cell division protein FtsZ  69.92 
 
 
383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0351517  hitchhiker  0.00000964056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3587  cell division protein FtsZ  69.42 
 
 
383 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00015207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00096  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3505  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0097  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000652178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00095  hypothetical protein  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0103  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000359609  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3562  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000263859  normal  0.0129736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0149  cell division protein FtsZ  70.07 
 
 
383 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000359528  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0150  cell division protein FtsZ  70.07 
 
 
383 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000113704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0101  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.47391e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0088  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0145  cell division protein FtsZ  70.07 
 
 
383 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000120308  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0641  cell division protein FtsZ  70.13 
 
 
383 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000009696  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0100  cell division protein FtsZ  70.43 
 
 
383 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  normal  0.622573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0142  cell division protein FtsZ  69.83 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000809484  normal  0.893784 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2640  cell division protein FtsZ  67.88 
 
 
411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000115675  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0517  cell division protein FtsZ  65.5 
 
 
390 aa  456  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0775  cell division protein FtsZ  65.91 
 
 
384 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2447  cell division protein FtsZ  64.14 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00131547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  62.72 
 
 
382 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2195  cell division protein FtsZ  62.28 
 
 
385 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000389118  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  62.87 
 
 
386 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0853  cell division protein FtsZ  62.25 
 
 
390 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0927  cell division protein FtsZ  60.4 
 
 
397 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000000829839  normal  0.686673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2187  cell division protein FtsZ  63.54 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0151273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4979  cell division protein FtsZ  59.75 
 
 
394 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0056047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2662  cell division protein FtsZ  63.38 
 
 
398 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2532  cell division protein FtsZ  63.07 
 
 
398 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4668  cell division protein FtsZ  59.1 
 
 
398 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910639  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13300  cell division protein FtsZ  59.9 
 
 
394 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00394916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0230  cell division protein FtsZ  61.18 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.97821e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1966  cell division protein FtsZ  61.18 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000388917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4403  cell division protein FtsZ  58.99 
 
 
395 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00309218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4097  cell division protein FtsZ  58.99 
 
 
395 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0231249  normal  0.411425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  59.18 
 
 
380 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57275  cell division protein FtsZ  59.24 
 
 
394 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000484485  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0607  cell division protein FtsZ  56.86 
 
 
411 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2488  cell division protein FtsZ  58.78 
 
 
389 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0022713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1964  cell division protein FtsZ  56.86 
 
 
411 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000893853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2043  cell division protein FtsZ  56.86 
 
 
411 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000892067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2185  cell division protein FtsZ  62.16 
 
 
394 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000751691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1342  cell division protein FtsZ  59.6 
 
 
398 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00615474  decreased coverage  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4382  cell division protein FtsZ  59.6 
 
 
398 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000271138  normal  0.178882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0200  cell division protein FtsZ  58.88 
 
 
387 aa  381  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.719937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4507  cell division protein FtsZ  59.6 
 
 
398 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000253019  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2855  cell division protein FtsZ  63.27 
 
 
385 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000229546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2263  cell division protein FtsZ  56.17 
 
 
387 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00432482  hitchhiker  0.000536698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0949  cell division protein FtsZ  59.6 
 
 
398 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0379  cell division protein FtsZ  58.88 
 
 
387 aa  381  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000173126  normal  0.037859 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0363  cell division protein FtsZ  64.33 
 
 
371 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000281943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2609  cell division protein FtsZ  55.04 
 
 
409 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000986054  unclonable  0.00000000000462824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04362  cell division protein FtsZ  55.58 
 
 
396 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1698  cell division protein FtsZ  60.5 
 
 
454 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1152  cell division GTP-binding tubulin-like protein FtsZ  54.52 
 
 
388 aa  349  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000122202  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0560  cell division protein FtsZ  55.67 
 
 
396 aa  348  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0497  cell division protein FtsZ  50.88 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000633261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0514  cell division protein FtsZ  50.88 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0417  cell division protein FtsZ  50.62 
 
 
384 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0455  cell division protein FtsZ  53.33 
 
 
381 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000150066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2782  cell division protein FtsZ  48.08 
 
 
391 aa  329  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000504391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2003  cell division protein FtsZ  52.38 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00598535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3493  cell division protein FtsZ  52.68 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00398885  normal  0.338691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3063  cell division protein FtsZ  50.77 
 
 
383 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0617944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3968  cell division protein FtsZ  50 
 
 
383 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2064  cell division protein FtsZ  50.51 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000128315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3283  cell division protein FtsZ  50.37 
 
 
392 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000100989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2196  cell division protein FtsZ  50.68 
 
 
386 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0747  cell division protein FtsZ  51.94 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100663  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3539  cell division protein FtsZ  53 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1123  cell division protein FtsZ  53 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1325  cell division protein FtsZ  53 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>