21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21970 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  100 
 
 
495 aa  986    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  48.65 
 
 
472 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  49.67 
 
 
483 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  45.73 
 
 
454 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  47.37 
 
 
441 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  47.62 
 
 
468 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  47.37 
 
 
441 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  47.13 
 
 
458 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  46.97 
 
 
429 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  48.04 
 
 
453 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49534  predicted protein  26.57 
 
 
610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47802  predicted protein  23.13 
 
 
600 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  21.29 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  22.58 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  22.25 
 
 
435 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1267  major facilitator superfamily permease  26.28 
 
 
541 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.633668  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35682  FBT family transporter: folate/pteridine  25.68 
 
 
292 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32854  FBT family transporter: folate/pteridine  24.12 
 
 
547 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0956  hypothetical protein  30 
 
 
560 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  21.82 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1506  hypothetical protein  25.29 
 
 
564 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0478439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>