18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21239 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21239  H3.3  100 
 
 
136 aa  274  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32891  predicted protein  97.79 
 
 
136 aa  268  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17380  predicted protein  95.59 
 
 
136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00249476 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38934  predicted protein  95.59 
 
 
136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0906859 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_50872  histone H3 isoform 1b  92.65 
 
 
136 aa  258  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11841  histone H3 isoform 1a  92.65 
 
 
136 aa  258  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50695  histone H3 isoform 1c  92.65 
 
 
136 aa  258  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69601  predicted protein  87.5 
 
 
136 aa  244  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0806469  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00733  Histone H3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23753]  86.76 
 
 
136 aa  244  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013922  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00570  histone H3, putative  88.41 
 
 
138 aa  244  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17026  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90527  predicted protein  86.76 
 
 
136 aa  243  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73330  predicted protein  86.76 
 
 
136 aa  243  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136215  normal  0.357299 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02540  DNA binding protein, putative  87.68 
 
 
138 aa  243  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  65.19 
 
 
152 aa  169  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54259  predicted protein  77.08 
 
 
171 aa  150  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06554  hypothetical protein similar to histone H3 (Broad)  72.73 
 
 
191 aa  148  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29021  predicted protein  69.39 
 
 
135 aa  141  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0364167  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16843  predicted protein  68.69 
 
 
104 aa  139  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>