18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11841 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_50872  histone H3 isoform 1b  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11841  histone H3 isoform 1a  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50695  histone H3 isoform 1c  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17380  predicted protein  94.85 
 
 
136 aa  265  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00249476 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38934  predicted protein  94.85 
 
 
136 aa  265  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0906859 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32891  predicted protein  94.12 
 
 
136 aa  262  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21239  H3.3  92.65 
 
 
136 aa  258  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00733  Histone H3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23753]  89.71 
 
 
136 aa  250  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013922  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69601  predicted protein  89.71 
 
 
136 aa  249  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0806469  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90527  predicted protein  88.97 
 
 
136 aa  248  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73330  predicted protein  88.97 
 
 
136 aa  248  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136215  normal  0.357299 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00570  histone H3, putative  88.41 
 
 
138 aa  244  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17026  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02540  DNA binding protein, putative  88.41 
 
 
138 aa  244  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  69.63 
 
 
152 aa  176  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54259  predicted protein  78.12 
 
 
171 aa  153  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06554  hypothetical protein similar to histone H3 (Broad)  74.75 
 
 
191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29021  predicted protein  71.43 
 
 
135 aa  144  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0364167  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16843  predicted protein  69.7 
 
 
104 aa  143  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>