62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0253 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0253  protein of unknown function DUF552  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2922  protein of unknown function DUF552  56.47 
 
 
107 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1890  protein of unknown function DUF552  41.67 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000364374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  45.56 
 
 
191 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0549  protein of unknown function DUF552  52.05 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  45.56 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  52.05 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  52.05 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  52.05 
 
 
210 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  44.44 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  48.65 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  48.65 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  50.68 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  48.65 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  50.68 
 
 
198 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  44.83 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  46.84 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21471  hypothetical protein  43.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  47.95 
 
 
210 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  36.84 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  33.77 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  32.94 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  30.26 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13351  hypothetical protein  36.99 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.703237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  28.72 
 
 
186 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09230  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00237641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  30.77 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0311  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  35.14 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  32 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  25.68 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  32.84 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  26.67 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  26.67 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  38.89 
 
 
167 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  29.23 
 
 
197 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  22.47 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2361  hypothetical protein  25.58 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000014385  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  35.09 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  29.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  29.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  33.93 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  29.17 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  26.32 
 
 
267 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  24.49 
 
 
229 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  31.67 
 
 
175 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>