90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3001 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  100 
 
 		 107 aa  216  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  66.98 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  55.14 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  51.4 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3349  hypothetical protein  50.91 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000920139  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  47.17 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  50.47 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  50.47 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  49.06 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0277  putative addiction module killer protein  48.6 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2241  addiction module killer protein  47.12 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  43.4 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  42.45 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  48.86 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  48.51 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  39.62 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  49.43 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  38.46 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  44.94 
 
 		 96 aa  85.9  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  44.34 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  36.54 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  37.5 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  43.53 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  44.94 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  47.13 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  51.22 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  44.33 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  45.05 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  43.48 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  41.75 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  48.78 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  48.78 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  47.56 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  35.64 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  43.33 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  43.37 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  46.34 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3266  addiction module killer protein  46.34 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  38.46 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  37.14 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1814  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2739  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  42.27 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2689  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  40.38 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05544  hypothetical protein  49.25 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  41.3 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  44.74 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  45.45 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000000132448  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  38.68 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  36.67 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  39.13 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  40.2 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  46.34 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3081  hypothetical protein  40.21 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  45.12 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  41.11 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  33.65 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  30.39 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  42.05 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  37.36 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1836  hypothetical protein  31.91 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.204816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  43.9 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  45.12 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  39.36 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  43.9 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  43.9 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  43.9 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  35.05 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  43.9 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  36.59 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  43.06 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  36.54 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  41.46 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1427  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  47.92 
 
 		 51 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1200  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000134873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1331  addiction module killer protein  44.68 
 
 		 48 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0428301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  27.27 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  38.46 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  38.46 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>