43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  97.4 
 
 
77 aa  154  5e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  67.11 
 
 
77 aa  107  7e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  67.11 
 
 
77 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.14235e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  65.79 
 
 
98 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  66.67 
 
 
77 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  64.47 
 
 
77 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  65.33 
 
 
76 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  69.12 
 
 
76 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  77.97 
 
 
99 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  56.41 
 
 
79 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  52 
 
 
74 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  52 
 
 
74 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  52 
 
 
75 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  50.67 
 
 
75 aa  74.3  6e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  73.6  9e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  53.42 
 
 
73 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.05882e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  53.42 
 
 
73 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  51.39 
 
 
87 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  45.33 
 
 
74 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  50.67 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  50.67 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  41.89 
 
 
122 aa  58.2  4e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  57  7e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  45.45 
 
 
99 aa  57  8e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  45.21 
 
 
101 aa  56.6  1e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  43.94 
 
 
110 aa  54.3  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1839  putative outer membrane protein  45 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.549082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1672  putative outer membrane protein  45 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.147833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1602  putative outer membrane protein  45 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1670  hypothetical protein  45 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1611  hypothetical protein  45 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1772  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2057  protein of unknown function DUF1161  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.927614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01545  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01555  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.41179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1793  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1659  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2044  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1614  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2295  hypothetical protein  43.86 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98038e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  44.44 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>