30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0996 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  440  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  56.12 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  57.07 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 201 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  45.25 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  41.5 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  41.11 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  41.11 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  41.11 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  37.31 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 142 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.41 
 
 		 380 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>