12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0074 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  64 
 
 
53 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  60.42 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  68 
 
 
52 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  58.33 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  53.06 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  49.02 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  54.9 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0838  hypothetical protein  67.35 
 
 
52 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0040  hypothetical protein  48.98 
 
 
52 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  48.98 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0023  hypothetical protein  47.06 
 
 
53 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>