14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0838 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0838  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  64.71 
 
 
51 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  60.78 
 
 
53 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  65.38 
 
 
52 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  56.86 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  48.94 
 
 
71 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  50.98 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0375  hypothetical protein  45.1 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  50.98 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0017  hypothetical protein  58 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0040  hypothetical protein  46.15 
 
 
52 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0023  hypothetical protein  53.85 
 
 
53 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>