17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  64 
 
 		 51 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  66.04 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  73.08 
 
 		 52 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  58 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  55.77 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0375  hypothetical protein  54.72 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  58.49 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  55.32 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0838  hypothetical protein  60.78 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  52 
 
 		 51 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0040  hypothetical protein  50.98 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0018  hypothetical protein  44 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.908142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0018  hypothetical protein  46 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03370  hypothetical protein  53.19 
 
 		 53 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0017  hypothetical protein  56 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0023  hypothetical protein  49.06 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>