20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0117 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0117  Protein of unknown function DUF357  100 
 
 
187 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1782  hypothetical protein  44.79 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2069  hypothetical protein  41.24 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.792812  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0387  hypothetical protein  41.76 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0910313  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0789  hypothetical protein  38.55 
 
 
191 aa  92  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129497  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0959  Protein of unknown function DUF357  53.73 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0969  hypothetical protein  37.78 
 
 
93 aa  57.8  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00420162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2439  Protein of unknown function DUF357  54.55 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2413  Protein of unknown function DUF357  54.55 
 
 
94 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.263584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2901  hypothetical protein  35.56 
 
 
93 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.776185  hitchhiker  0.000281403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0783  Protein of unknown function DUF357  37.78 
 
 
95 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.332797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0752  hypothetical protein  40.68 
 
 
101 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0695034  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0069  hypothetical protein  40.68 
 
 
101 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.512447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1166  hypothetical protein  40.68 
 
 
101 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0553  Protein of unknown function DUF357  50.75 
 
 
94 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1386  Protein of unknown function DUF357  37.7 
 
 
97 aa  48.9  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.151308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0818  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0272  hypothetical protein  29.47 
 
 
109 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000195295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  46.67 
 
 
241 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2107  cytidyltransferase-like protein  33.8 
 
 
223 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>