18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1782 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1782  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0387  hypothetical protein  46.56 
 
 
186 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0910313  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0117  Protein of unknown function DUF357  44.79 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2069  hypothetical protein  43.78 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.792812  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0789  hypothetical protein  32.63 
 
 
191 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129497  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0959  Protein of unknown function DUF357  42.39 
 
 
94 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2901  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.776185  hitchhiker  0.000281403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0783  Protein of unknown function DUF357  45.16 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.332797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0969  hypothetical protein  39.78 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00420162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2439  Protein of unknown function DUF357  45.16 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0553  Protein of unknown function DUF357  45.65 
 
 
94 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2413  Protein of unknown function DUF357  48.19 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.263584 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1386  Protein of unknown function DUF357  34.88 
 
 
97 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.151308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0272  hypothetical protein  33.77 
 
 
109 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000195295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0069  hypothetical protein  33.77 
 
 
101 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.512447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1166  hypothetical protein  33.77 
 
 
101 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0752  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0695034  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0818  hypothetical protein  31.17 
 
 
101 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>