12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0646 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0646  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  769    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436257  normal  0.112784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0647  hypothetical protein  94.25 
 
 		 391 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  normal  0.0829547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69510  hypothetical protein  32.86 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133748  normal  0.588689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  27.25 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0040  hypothetical protein  32.76 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0843  hypothetical protein  30.77 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  23.62 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  22.95 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  22.79 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  22.71 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>