15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0080 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0080  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  276  9e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0969953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0531  putative transcriptional regulator  64.18 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.360925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0563  putative transcriptional regulator  61.94 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.860216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0330  putative transcriptional regulator  63.91 
 
 		 134 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.489356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2254  putative transcriptional regulator  63.91 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000419083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0464  putative transcriptional regulator  55 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0719  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3326  DNA binding protein, Tfx family  35.71 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1201  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1391  DNA binding protein, Tfx family  34.13 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2543  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1085  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0861  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.259163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1098  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1590  putative transcriptional regulator  35.66 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>