142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl089 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl089  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 54 aa  108  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0112  50S ribosomal protein L33  69.23 
 
 		 53 aa  78.2  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2408  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 		 49 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00953034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 		 48 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 50 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf096  ribosomal protein L33  58 
 
 		 48 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  48.08 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  52.17 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  58 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0091  50S ribosomal protein L33  51.06 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  50 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  48.89 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 56 aa  50.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  44.44 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 49 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  48.15 
 
 		 54 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  44.44 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  46.67 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  38.89 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  47.83 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  44.23 
 
 		 54 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0557  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 47 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0127832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0571  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 47 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 55 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0095  ribosomal protein L33  51.06 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000218198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  43.48 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  43.48 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0175  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 47 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0634965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0346  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000111455  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  42.22 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0687  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  45.16 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  41.86 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0612  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0833  50S ribosomal protein L33P  37.78 
 
 		 51 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169832  normal  0.0907475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 52 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>