73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0017 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1625  lysyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 568 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279844  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3971  lysyl-tRNA synthetase  69.67 
 
 		 551 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1321  lysyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 530 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0017  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 553 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0432  lysyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 539 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2384  lysyl-tRNA synthetase  66 
 
 		 565 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1576  lysyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 530 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286152  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0201  lysyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 543 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1000  lysyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 545 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771898  normal  0.632109 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0741  lysyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 551 aa  783    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0730  lysyl-tRNA synthetase  66.91 
 
 		 546 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2980  lysyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 582 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6283  lysyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 		 567 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0888  lysyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 545 aa  737    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1360  lysyl-tRNA synthetase  68.8 
 
 		 553 aa  800    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0790  lysyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 548 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677714  hitchhiker  0.00421967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1065  lysyl-tRNA synthetase  69.85 
 
 		 567 aa  778    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.115893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0151  lysyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 543 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3162  lysyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 567 aa  680    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5166  lysyl-tRNA synthetase  66.54 
 
 		 545 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3798  lysyl-tRNA synthetase  65.64 
 
 		 585 aa  748    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3206  lysyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 567 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0790  lysyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 551 aa  784    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7217  lysyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 567 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0137  lysyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 552 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0487  lysyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 526 aa  611  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.481224  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2206  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 552 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.485423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0503  lysyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 550 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0584  lysyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 526 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2237  lysyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 526 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2261  lysyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0509  lysyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 529 aa  582  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0707  lysyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0860  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3617  lysyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 548 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.983213  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0268  lysyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0782951  normal  0.684652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3566  lysyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279975  normal  0.84851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0463  lysyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0614307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0626  lysyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2360  lysyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0413  lysyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 511 aa  512  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.738039  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0773  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0578  lysyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0679  lysyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2387  lysyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.353183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1509  lysyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1974  lysyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1293  lysyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 600 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2553  lysyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.584812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3478  lysyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 553 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2651  lysyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0307953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2815  lysyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 533 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000378185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2567  lysyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2757  lysyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000778634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2340  lysine--tRNA ligase, class I (lysyl-tRNA synthetase, class I)  28.61 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2375  lysine--tRNA ligase (lysyl-tRNA synthetase)  27.47 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0116  lysyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2180  lysyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 492 aa  98.2  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.02262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0563  lysyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 533 aa  94.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0922  lysyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 524 aa  94.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4154  lysyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 527 aa  94  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1865  lysyl-tRNA synthetase  22.79 
 
 		 528 aa  93.6  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0275  lysyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1618  lysine--tRNA ligase  23.18 
 
 		 641 aa  92  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1355  lysyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 533 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0629  lysyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0773  lysyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0215  lysyl-tRNA synthetase  19.81 
 
 		 545 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273119  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0786  lysyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.930737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0571  lysyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 462 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>