17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00293 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00293  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3220  hypothetical protein  64.14 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000447728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3560  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3886  hypothetical protein  62.76 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0728  hypothetical protein  60.13 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4245  hypothetical protein  46.98 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000472538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2814  hypothetical protein  38.76 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0499  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2061  hypothetical protein  35.21 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0147  hypothetical protein  36.92 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1339  hypothetical protein  39.53 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0070  hypothetical protein  36.92 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0073  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1073  hypothetical protein  25.71 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.440482  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1691  hypothetical protein  29.77 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1844  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2941  hypothetical protein  28.24 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>