36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1666 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  229  9e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  56.14 
 
 
143 aa  131  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  51.69 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  41.9 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  40.37 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  33.05 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  38.94 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  38.94 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  39.45 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  39.45 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  40.57 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  39.45 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  38.53 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  37.96 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  39.45 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  38.53 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  35.04 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  35.45 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  34.51 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  37.07 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  36.13 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  36.79 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  36.29 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  36.13 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  42.03 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  33.02 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  30.97 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  32.41 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  35.4 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  28.8 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  28.8 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>