249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0218 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  100 
 
 
39 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  87.18 
 
 
39 aa  71.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  79.49 
 
 
39 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  65.1  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  65.79 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
37 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
41 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
46 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  60.53 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  52.63 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20630  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0927005  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  63.16 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  58.97 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103834  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0712  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1168  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000359865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
37 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0651  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 
38 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29490  LSU ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144849  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6587  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
37 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0960  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0606  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
37 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>