18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00870    100 
 
 
333 bp  660  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  86.11 
 
 
1008 bp  95.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  86.46 
 
 
1008 bp  87.7  2e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  86.52 
 
 
1008 bp  81.8  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  86.52 
 
 
1008 bp  81.8  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  86.52 
 
 
1008 bp  81.8  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  85.39 
 
 
1008 bp  73.8  3e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  84.62 
 
 
1056 bp  60  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  82.35 
 
 
1008 bp  60  4e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  84.62 
 
 
1056 bp  60  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  82.18 
 
 
963 bp  58  2e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  87.72 
 
 
1098 bp  58  2e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  85 
 
 
1005 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  96.3 
 
 
993 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  96.3 
 
 
993 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  96.3 
 
 
993 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  2.89484e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  96.3 
 
 
1044 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  96.3 
 
 
993 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>