17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1640 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  316  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0397  hypothetical protein  26.05 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  32.18 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 158 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  25.56 
 
 		 139 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  24 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  26.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  27.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25.71 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  27.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  27.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25.42 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>