22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3327 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  2e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  61.69 
 
 
154 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  63.23 
 
 
159 aa  195  2e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  57.79 
 
 
156 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  48.7 
 
 
159 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  42.76 
 
 
157 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  41.83 
 
 
157 aa  123  8e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  42.48 
 
 
157 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  117  5e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  42.55 
 
 
158 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.34724e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  39.44 
 
 
160 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  42.55 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  38.31 
 
 
169 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  34.92 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  33.81 
 
 
180 aa  79.3  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  28.08 
 
 
167 aa  54.7  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  35.82 
 
 
67 aa  53.5  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12991  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>