14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2504 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2504  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.037492  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2511  hypothetical protein  59.26 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1824  hypothetical protein  59.57 
 
 
61 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1289  hypothetical protein  53.85 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0951053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2132  hypothetical protein  59.57 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000336864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2085  hypothetical protein  56.25 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62611e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1951  hypothetical protein  47.92 
 
 
62 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000336619  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1032  hypothetical protein  46.81 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1074  hypothetical protein  40.38 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0048  hypothetical protein  40.82 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3229  hypothetical protein  44.68 
 
 
91 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0047  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000731108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0051  hypothetical protein  43.75 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0050  hypothetical protein  43.75 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>