16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1118 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1118  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0746  hypothetical protein  63.04 
 
 
273 aa  304  9e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10185  hypothetical protein  55.47 
 
 
249 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0516  hypothetical protein  59.71 
 
 
250 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0152  hypothetical protein  58.61 
 
 
271 aa  270  3e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0298803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0142  hypothetical protein  58.55 
 
 
249 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0151  hypothetical protein  58.55 
 
 
249 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0132  hypothetical protein  57.45 
 
 
249 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0098  hypothetical protein  50.9 
 
 
278 aa  243  4e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  30.65 
 
 
467 aa  66.2  5e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  28.93 
 
 
451 aa  56.2  6e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  29.35 
 
 
497 aa  53.5  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  29.35 
 
 
497 aa  53.5  4e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  29.35 
 
 
429 aa  53.5  4e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  33.88 
 
 
430 aa  51.6  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  27.46 
 
 
440 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>