21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3978 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  350  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  55.48 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  58.55 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  43.87 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  43.41 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  41.18 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  42.19 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  40.62 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  38.31 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  34.64 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  36.43 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  32.47 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  37.33 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  34.27 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  32.47 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  32.21 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  36.84 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>