19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0024 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  100 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  65.45 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  38.36 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.29 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  34.38 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  28.45 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  32.37 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  41.57 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  33.48 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  30.63 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  33.57 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  33.96 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  34.01 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  31.01 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.69 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  30.3 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  28.15 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  28.09 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>