35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2774 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2774  small terminase subunit  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3047  terminase, endonuclease subunit  99.54 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0927  terminase, endonuclease subunit  99.07 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2865  terminase, endonuclease subunit  95.37 
 
 		 216 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3174  small terminase subunit  52.58 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4367  gpM  49.29 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  hitchhiker  0.00000000191382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4838  small terminase subunit  48.84 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0204  small terminase subunit  48.85 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1396  phage small terminase subunit  52.29 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1936  bacteriophage protein  46.05 
 
 		 240 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.381578  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3498  phage small terminase subunit  49.77 
 
 		 251 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4326  phage small terminase subunit GpM  48.58 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3049  phage small terminase subunit GpM  48.11 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37580  Phage P2 small terminase subunit gpM-like protein  45.91 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1349  Phage small terminase subunit  45.83 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01360  phage-related terminase  43.29 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0374547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3292  phage small terminase subunit  42.61 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2330  small terminase subunit  38.03 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2913  small terminase subunit  38.02 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.193683  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2644  small terminase subunit  40.18 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3830  small terminase subunit  35.27 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0900  small terminase subunit  25.11 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0679856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0701  putative terminase, endonuclease subunit  31.79 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5055  putative terminase, endonuclease subunit  31.79 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0698  hypothetical protein  23.36 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2797  phage terminase subunit  24.89 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2764  phage small terminase subunit  31.46 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.734081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1469  phage small terminase subunit  31.46 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1054  putative terminase, endonuclease subunit  35.58 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0584  phage small terminase subunit  29.17 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.823019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3490  phage terminase subunit  24.86 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.745840000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0242  small terminase subunit  27.96 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2933  phage terminase subunit  24.86 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.4642299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0940  small terminase subunit  33.02 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05028  hypothetical protein  28.87 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>