10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0052 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1194    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0781  KAP P-loop domain-containing protein  24.18 
 
 		 606 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3423  hypothetical protein  23.84 
 
 		 579 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4279  KAP P-loop domain protein  28.82 
 
 		 528 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  28.78 
 
 		 559 aa  50.8  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3630  KAP P-loop domain-containing protein  28.16 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1996  hypothetical protein  24.38 
 
 		 583 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5228  KAP P-loop domain protein  35.9 
 
 		 210 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2406  KAP P-loop domain protein, putative  24.28 
 
 		 665 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109469  normal  0.0676098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>