More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0084 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
173 aa  344  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  98.84 
 
 
173 aa  340  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  99.39 
 
 
163 aa  322  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  99.39 
 
 
163 aa  322  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  98.77 
 
 
163 aa  320  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.95 
 
 
164 aa  319  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.95 
 
 
164 aa  319  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  98.77 
 
 
163 aa  319  1e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.95 
 
 
164 aa  319  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  98.77 
 
 
163 aa  319  1e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  98.77 
 
 
163 aa  319  1e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  98.77 
 
 
163 aa  319  1e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.95 
 
 
164 aa  319  1e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.93 
 
 
169 aa  317  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0625  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  95.09 
 
 
163 aa  313  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  88.96 
 
 
163 aa  298  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  88.96 
 
 
163 aa  298  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  88.96 
 
 
163 aa  298  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  89.57 
 
 
163 aa  297  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  87.73 
 
 
163 aa  293  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  87.04 
 
 
164 aa  287  5e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  87.04 
 
 
164 aa  287  5e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  87.04 
 
 
164 aa  287  5e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.17 
 
 
164 aa  248  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
164 aa  244  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.78 
 
 
164 aa  243  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.78 
 
 
164 aa  243  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.78 
 
 
164 aa  243  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.17 
 
 
164 aa  242  2e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  69.33 
 
 
164 aa  240  8e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.76129e-05  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  4.04141e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.55 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  69.33 
 
 
164 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.26 
 
 
164 aa  236  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  67.48 
 
 
164 aa  235  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1910  acetolactate synthase, small subunit  66.87 
 
 
164 aa  235  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.64 
 
 
164 aa  234  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2705  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.26 
 
 
164 aa  234  5e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
164 aa  233  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.26 
 
 
164 aa  233  1e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
164 aa  233  1e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62150  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
163 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0299879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
163 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.43 
 
 
163 aa  221  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  hitchhiker  5.12539e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0755  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
163 aa  221  5e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100684  hitchhiker  2.73125e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4677  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
163 aa  221  5e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  hitchhiker  3.35837e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4679  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
163 aa  221  5e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.2 
 
 
163 aa  221  5e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  hitchhiker  0.000231458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0982  acetolactate synthase, small subunit  63.58 
 
 
163 aa  220  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.58 
 
 
163 aa  220  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4787  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
163 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0258419  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42510  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.11 
 
 
163 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.73 
 
 
163 aa  216  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
163 aa  215  3e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.67629e-09  hitchhiker  5.55489e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
163 aa  214  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3431  acetolactate synthase, small subunit  64.24 
 
 
166 aa  210  6e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.418353  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.96 
 
 
165 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  62.5 
 
 
163 aa  207  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  60.49 
 
 
163 aa  207  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.93 
 
 
164 aa  201  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.76 
 
 
164 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  56.71 
 
 
165 aa  201  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.9 
 
 
163 aa  200  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  59.26 
 
 
163 aa  199  1e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0635  acetolactate synthase, small subunit  61.88 
 
 
163 aa  199  1e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0625  acetolactate synthase, small subunit  57.32 
 
 
165 aa  199  2e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.71 
 
 
165 aa  199  2e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  60 
 
 
161 aa  199  2e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.28 
 
 
163 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  59.12 
 
 
163 aa  198  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.51 
 
 
163 aa  197  4e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.51 
 
 
163 aa  197  4e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.12 
 
 
163 aa  197  4e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.51 
 
 
163 aa  197  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  59.88 
 
 
166 aa  197  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  197  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  196  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
163 aa  196  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.12 
 
 
163 aa  196  1e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  59.63 
 
 
164 aa  196  1e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.9 
 
 
163 aa  196  2e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.28 
 
 
163 aa  195  2e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.28 
 
 
163 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.9 
 
 
163 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>