41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2794 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  98.18 
 
 
1371 bp  2506  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.49221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.56 
 
 
1371 bp  2656  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.48025e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2794    100 
 
 
1371 bp  2718  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.77059e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  97.89 
 
 
1371 bp  2474  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.33307e-06  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  94.43 
 
 
1368 bp  1810  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.23152e-09  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  97.89 
 
 
1371 bp  2474  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  97.59 
 
 
1371 bp  2442  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.26312e-08  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  98.18 
 
 
1371 bp  2506  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.02008e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  98.18 
 
 
1371 bp  2506  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.42965e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  82.11 
 
 
1350 bp  428  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  80.97 
 
 
1350 bp  424  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.63372e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  80.97 
 
 
1350 bp  424  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.99903e-06  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.31 
 
 
1350 bp  412  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.5005e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.73 
 
 
1350 bp  404  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.57 
 
 
1374 bp  402  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  2.10085e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  85.59 
 
 
1377 bp  198  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.30865e-09  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  83.27 
 
 
1395 bp  161  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  84.21 
 
 
1389 bp  153  2e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  82.59 
 
 
1398 bp  135  4e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.22836e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.94 
 
 
1386 bp  125  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.45996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.29 
 
 
1377 bp  77.8  8e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.29 
 
 
1380 bp  77.8  8e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.14365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  81.29 
 
 
1380 bp  77.8  8e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.34785e-10  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  94.74 
 
 
1179 bp  60  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  83.53 
 
 
1431 bp  58  7e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  92.68 
 
 
1344 bp  58  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.46 
 
 
1377 bp  56  3e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  83.13 
 
 
1377 bp  54  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.44 
 
 
1371 bp  54  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
1491 bp  54  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  96.77 
 
 
1332 bp  54  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  90.48 
 
 
1461 bp  52  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.89 
 
 
1404 bp  50.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  88.89 
 
 
1341 bp  50.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  2.7114e-06  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  93.94 
 
 
1338 bp  50.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  93.94 
 
 
1341 bp  50.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.01941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.64 
 
 
1344 bp  48.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  88.64 
 
 
1335 bp  48.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  83.82 
 
 
1209 bp  48.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1511  exodeoxyribonuclease VII large subunit  85 
 
 
1356 bp  48.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.823365  normal  0.344595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2204  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.64 
 
 
1461 bp  48.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>