More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5441 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.04819e-09  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.4857e-06  hitchhiker  1.10779e-12 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.02716e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  9.60939e-08  hitchhiker  8.35142e-13 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.65207e-09  hitchhiker  4.65726e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.76988e-07  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  7.4305e-05  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.4435e-06  hitchhiker  8.76352e-15 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.83891e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.88593e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.15507e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.69748e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.11587e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.68631e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.27431e-06  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.4405e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.0947e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.58604e-06  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  6.31755e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.0133e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.2371e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.03931e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.15552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  5.29436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  5.34878e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0670  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5029  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  8.57457e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  1.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2036  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.05552e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0072  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  7.42395e-08  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.60506e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.45493e-06  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  6.24593e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  4.06806e-05  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  97.92 
 
 
155 bp  87.7  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  97.78 
 
 
76 bp  81.8  2e-14  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  95.83 
 
 
78 bp  79.8  8e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.17541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  95.83 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  2.3441e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.91547e-07  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.77619e-05  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  9.04299e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.27626e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.57949e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  8.32804e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  94.12 
 
 
78 bp  77.8  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  7.48575e-08  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.51402e-09  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.50992e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.82152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.06405e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.40276e-07  hitchhiker  1.36531e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.12436e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  94.12 
 
 
78 bp  77.8  3e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.24978e-12  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.00666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  4.51939e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.81943e-08  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.51608e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.02791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.32706e-06  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.22273e-06  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.91032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.77909e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  92.73 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>