75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4653 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4653  sulfur relay protein TusC  100 
 
 
119 aa  239  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.51233e-09  decreased coverage  0.00984076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0369  sulfur relay protein TusC/DsrF  97.48 
 
 
119 aa  234  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.99316e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0369  sulfur relay protein TusC  97.48 
 
 
119 aa  234  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.31673e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3625  sulfur relay protein TusC  97.48 
 
 
119 aa  234  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.32932e-08  hitchhiker  0.000966126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3540  sulfur relay protein TusC  96.64 
 
 
119 aa  231  2e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.90138e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3718  sulfur relay protein TusC  96.64 
 
 
119 aa  231  2e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.63718e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03195  hypothetical protein  96.64 
 
 
119 aa  231  2e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.6186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03146  hypothetical protein  96.64 
 
 
119 aa  231  2e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.75023e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3813  sulfur relay protein TusC  95.8 
 
 
119 aa  230  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.46235e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3818  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
118 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  8.2368e-05  normal  0.881738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3647  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
118 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.33415e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3646  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
118 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.15464e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3755  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
118 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0243963  normal  0.0807974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3720  sulfur relay protein TusC  84.03 
 
 
118 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  5.69521e-06  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0314  sulfur relay protein TusC  64.71 
 
 
119 aa  163  7e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000155532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3761  sulfur relay protein TusC  62.18 
 
 
119 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.07617e-06  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4553  sulfur relay protein TusC  62.18 
 
 
119 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.75116e-08  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3680  sulfur relay protein TusC  58.47 
 
 
121 aa  151  3e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.1238e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3923  sulfur relay protein TusC  58.47 
 
 
121 aa  151  3e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.67034e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0273  sulfur relay protein TusC  58.47 
 
 
121 aa  151  3e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000969658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0396  sulfur relay protein TusC  59.66 
 
 
119 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00209341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4012  sulfur relay protein TusC  55.46 
 
 
119 aa  143  7e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0119239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2769  hypothetical protein  52.1 
 
 
118 aa  128  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.35142e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3832  sulfur relay protein TusC  57.98 
 
 
119 aa  127  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002295  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusC  47.9 
 
 
118 aa  123  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.67918e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00059  sulfur oxidation protein dsrF  47.9 
 
 
118 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0308  intracellular sulfur oxidation protein DsrF  43.7 
 
 
118 aa  116  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00506784  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0490  intracellular reduction protein DsrF  42.86 
 
 
119 aa  113  7e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1634  sulfur relay protein TusC  46.28 
 
 
120 aa  113  7e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3442  intraceullular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  45.76 
 
 
120 aa  111  4e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00176558  decreased coverage  2.58214e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2109  DsrE family protein  42.02 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.80697e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2453  DsrE-like protein  40.34 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.3855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2134  DsrE family protein  39.5 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2207  DsrE family protein  39.5 
 
 
118 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.32084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2315  DsrE family protein  39.5 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.69455e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2164  DsrE family protein  39.5 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.49847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2199  sulfur relay protein TusC/DsrF  39.5 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.09085e-08  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2016  DsrE family protein  46.07 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.18416e-07  hitchhiker  0.00293118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2377  hypothetical protein  39.5 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1780  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129474  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2475  sulfur relay protein TusC/DsrF  36.97 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.7819e-05  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1656  DsrE family protein  38.66 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2058  DsrE family protein  36.97 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0573181  hitchhiker  0.000337612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28130  sulfur relay protein TusC  42.24 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2003  DsrE family protein  36.13 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.82885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1971  DsrE family protein  36.97 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.39065e-05  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2005  DsrE family protein  36.97 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0519969  hitchhiker  0.000302013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1807  DsrE-like protein  36.97 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.42115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1802  DsrE family protein  35.29 
 
 
118 aa  83.2  1e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0041  DsrF protein  33.61 
 
 
122 aa  79  2e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.630968  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2482  DsrF protein  30.25 
 
 
131 aa  78.6  3e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.067971  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2316  sulfur relay protein TusC/DsrF  35.59 
 
 
129 aa  77.8  5e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0137343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1951  DsrF protein  36.44 
 
 
123 aa  77  9e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0170075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1852  sulfur relay protein TusC/DsrF  34.19 
 
 
121 aa  73.6  9e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000304712  normal  0.0727441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0133  DsrE family protein  38.02 
 
 
129 aa  73.6  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.09278e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2188  sulfur relay protein TusC/DsrF  32.77 
 
 
130 aa  71.6  3e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.946925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1954  DsrE family protein  33.61 
 
 
130 aa  70.9  5e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.414828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0034  sulfur relay protein TusC/DsrF  33.9 
 
 
125 aa  70.9  6e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0700  sulfur relay protein TusC/DsrF  38.64 
 
 
123 aa  69.7  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.137823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2348  putative sulfur oxidation protein DsrF  31.03 
 
 
121 aa  68.6  3e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0587865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1924  DsrE-like protein  33.63 
 
 
126 aa  67.4  7e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3169  sulfur relay protein TusC  37.93 
 
 
120 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.107229  normal  0.263841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2602  sulfur relay protein TusC  35.29 
 
 
119 aa  63.5  8e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3599  sulfur relay protein TusC  31.9 
 
 
119 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30390  sulfur relay protein TusC  33.33 
 
 
119 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1839  sulfur relay protein TusC  31.9 
 
 
119 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000201161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3994  sulfur relay protein TusC  31.9 
 
 
119 aa  61.6  4e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0906893  hitchhiker  0.00530974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1705  DsrE family protein  27.73 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.95372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3398  sulfur relay protein TusC  31.9 
 
 
119 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.451628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3339  DsrF family protein  34.48 
 
 
120 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3576  sulfur relay protein TusC  30.17 
 
 
118 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2378  sulfur relay protein TusC  30.17 
 
 
119 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.643649  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02105  DsrE family protein  28.09 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0434  DsrE-like protein  26.05 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1520  DsrE family protein  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.435387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>