26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01529 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01529  predicted protein  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  93.48 
 
 		 349 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  93.48 
 
 		 349 aa  360  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  93.48 
 
 		 349 aa  360  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  83.15 
 
 		 349 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  84.24 
 
 		 348 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  82.07 
 
 		 349 aa  322  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  82.07 
 
 		 349 aa  321  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  81.52 
 
 		 349 aa  320  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  81.52 
 
 		 349 aa  320  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  81.52 
 
 		 349 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  80.43 
 
 		 349 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  78.26 
 
 		 349 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  73.22 
 
 		 351 aa  264  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  73.22 
 
 		 351 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  68.48 
 
 		 329 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  68.48 
 
 		 329 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  70.49 
 
 		 351 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  64.13 
 
 		 331 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  64.13 
 
 		 331 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  61.54 
 
 		 329 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  54.89 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1000  hypothetical protein  89.47 
 
 		 78 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01963  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  121  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0881  hypothetical protein  37.29 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0865  hypothetical protein  37.29 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>