17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1000 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1000  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  93.59 
 
 		 351 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  93.59 
 
 		 351 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  90.79 
 
 		 349 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  91.03 
 
 		 351 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  89.47 
 
 		 349 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  93.42 
 
 		 348 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  86.84 
 
 		 349 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01529  predicted protein  89.47 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  86.84 
 
 		 349 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  86.84 
 
 		 349 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  86.84 
 
 		 349 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  84.21 
 
 		 349 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  85.53 
 
 		 349 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  84.21 
 
 		 349 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  84.21 
 
 		 349 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  84.21 
 
 		 349 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>