More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1798 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1798  anthranilate synthase component II  100 
 
 
201 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000393532  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1141  anthranilate synthase component II  82.01 
 
 
193 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3099  anthranilate synthase component II  80.85 
 
 
193 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.757854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2002  anthranilate synthase component II  80.85 
 
 
195 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0712  anthranilate synthase component II  80.85 
 
 
195 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.089943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3171  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  70.97 
 
 
197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511386  normal  0.171933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1880  anthranilate synthase, component II  70.62 
 
 
195 aa  278  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573908  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2136  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.15 
 
 
196 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198158  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1895  anthranilate synthase, component II  70.43 
 
 
196 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.408406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1401  anthranilate synthase component II  64.71 
 
 
196 aa  249  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.579045  hitchhiker  0.000682875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
188 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  60.11 
 
 
189 aa  247  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  61.46 
 
 
192 aa  246  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  60.43 
 
 
189 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  59.89 
 
 
189 aa  243  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  60.96 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2776  anthranilate synthase component II  61.5 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000091878  hitchhiker  0.00000280107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  58.06 
 
 
189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58 
 
 
544 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4377  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.39 
 
 
200 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
190 aa  240  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  59.68 
 
 
188 aa  240  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.64 
 
 
204 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2446  anthranilate synthase, component II  60.1 
 
 
197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  59.39 
 
 
201 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.68 
 
 
188 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
195 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1552  anthranilate synthase, component II  59.49 
 
 
198 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  56.99 
 
 
192 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  58.21 
 
 
202 aa  237  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  60.11 
 
 
204 aa  237  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.39 
 
 
193 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  58.51 
 
 
189 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  60.42 
 
 
194 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02601  para-aminobenzoate synthase component II  59.49 
 
 
198 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.468675  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.83 
 
 
190 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  61.83 
 
 
190 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  59.9 
 
 
194 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3227  anthranilate synthase, component II  61.29 
 
 
206 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
190 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2022  anthranilate synthase, component II  61.83 
 
 
195 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  58.38 
 
 
201 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.68 
 
 
188 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  59.14 
 
 
195 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 
189 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1911  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.04 
 
 
204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  59.14 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0157  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.73 
 
 
198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.29 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  58.29 
 
 
189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  58.06 
 
 
200 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  58.73 
 
 
205 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  55.73 
 
 
192 aa  234  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2324  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.07 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2273  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.07 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  60.21 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3557  anthranilate synthase component II  58.06 
 
 
196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  57.53 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  58.88 
 
 
197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  57.75 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
191 aa  232  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  59.68 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  59.68 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  59.68 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  59.68 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.46 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  57.45 
 
 
189 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2128  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.07 
 
 
197 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04000  anthranilate synthase component II  60.11 
 
 
189 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  58.82 
 
 
187 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27421  para-aminobenzoate synthase component II  60.1 
 
 
202 aa  230  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  58.67 
 
 
199 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  57.29 
 
 
197 aa  230  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.91 
 
 
188 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.12 
 
 
191 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2037  anthranilate synthase component II  56.45 
 
 
187 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  55.91 
 
 
190 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  53.76 
 
 
195 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02021  para-aminobenzoate synthase component II  55.96 
 
 
201 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.410499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.66 
 
 
192 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.12 
 
 
202 aa  229  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  55.38 
 
 
190 aa  229  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.67 
 
 
197 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  58.67 
 
 
199 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
199 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
199 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  55.91 
 
 
190 aa  228  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1850  anthranilate synthase component II  56.68 
 
 
193 aa  228  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  58.33 
 
 
193 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  57.87 
 
 
197 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  57.53 
 
 
189 aa  228  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  57.87 
 
 
197 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  57.87 
 
 
197 aa  227  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>