17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0431 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0431  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.600606  normal  0.255698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0805  hypothetical protein  69.06 
 
 
184 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1349  hypothetical protein  67.76 
 
 
184 aa  278  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2019  hypothetical protein  69.06 
 
 
184 aa  275  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000794763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2966  hypothetical protein  67.21 
 
 
184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.927571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1632  hypothetical protein  58.01 
 
 
182 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.118515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0055  hypothetical protein  56.76 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0549  hypothetical protein  49.44 
 
 
431 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2291  hypothetical protein  47.54 
 
 
434 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1661  hypothetical protein  45 
 
 
431 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2814  hypothetical protein  43.89 
 
 
430 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.512389  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1584  hypothetical protein  46.11 
 
 
431 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
451 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
451 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
451 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
451 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
451 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>