14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0480 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  792    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000208075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2036  hypothetical protein  23.45 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0370  hypothetical protein  22.18 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000001896  normal  0.85834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.93 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  25.27 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  24.07 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23.89 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  20.65 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  27.59 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.21 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  20.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  19.35 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  17.58 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.62 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>